Junto con el card de Boston, Seán O'Malley, el ob. de san Diego, McElroy fue uno de los dos representantes de la Iglesia de EE. UU. seleccionados cuidadosamente por el Papa Francisco para asistir al sínodo.
McElroy, un líder liberal de la Iglesia, ha sido noticia en los últimos años con su intento de trazar un nuevo curso liberal para su diócesis. En agosto de 2018, el denunciante del Vaticano Carlo Maria Viganò, ex nuncio papal en los Estados Unidos, afirmó que McElroy fue especialmente elegido para orquestar la infiltración homosexual de la diócesis de San Diego.
Según Viganò, el nombramiento de McElroy llegó por orden del Secretario de Estado del Vaticano el card Pietro Parolin, quien, junto con el Papa Francisco y varios de sus asesores, encubrieron la historia de Theodore McCarrick como un depredador sexual en serie."El nombramiento de McElroy en San Diego también fue orquestado desde arriba", escribió Viganò, "con una orden perentoria cifrada para mí como Nuncio, por el cardenal Parolin: 'Reserve la sede de San Diego para McElroy'"
Una vez en el poder, McElroy promovió, y protegió, la creciente red de homosexuales en su propia diócesis y más allá. En agosto de 2016, el reconocido investigador clerical de abuso sexual Richard Sipe informó a McElroy que McCarrick había abusado sexualmente de hombres y menores jóvenes durante décadas. El obispo no dijo y ni hizo nada en respuesta a la advertencia de Sipe.
-El obispo de San Diego, Robert McElroy ha anunciado su respaldo a las mujeres diáconos. Aparentemente es la primera vez que un prelado de EE. UU lo hace, desde que el Papa Francisco lanzó una comisión para estudiar la cuestión de la creación de un diaconado femenino en 2016. Cuando el Sínodo del Amazonas llegó a su fin el domingo, McElroy le dijo al National Catholic Reporter que espera que la comisión finalmente llegue a "una conclusión de que no esté prohibido ordenar mujeres al diaconado"."Estoy a favor", dijo. "Mi opinión al respecto es [que] las mujeres deberían ser invitadas a todos los ministerios o actividades que tenemos que no estén prohibidos doctrinalmente".
El sábado, el Papa Francisco anunció que, en respuesta a la recomendación del documento final del sínodo, volverá a convocar a su comisión sobre las mujeres diáconos para su posterior estudio. Reflexionando sobre la promesa del Papa, McElroy le dijo a Catholic News Service "eso me indica que hay una nueva vida para esa propuesta".
Entre los padres sinodales "hubo un tremendo apoyo visceral para el trabajo que las mujeres están haciendo en el Amazonas", observó el obispo, sugiriendo que "por eso el apoyo fue tan fuerte en la cuestión del diaconado"."Espero que encuentren un camino para hacer que eso sea una realidad", dijo McElroy. "Creo que hay una buena posibilidad de que esa sea la dirección en la que se dirigirá el Papa".
McElroy señaló que en su discusión, los obispos no limitaron la posibilidad de las mujeres diáconos al Amazonas."Creo que el papel de las mujeres y la cuestión del diaconado es importante", dijo, sugiriendo que podría imaginarlos en San Diego.
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